上海社会科学院台港澳交流办公室简称台港澳办，是上海社科院负责管理与台港澳地区学术交流的部门。台港澳办的工作包括：办理全院人员赴台港澳地区访问、讲学、研究、短期工作的相关手续；接待来院访问的台港澳地区专家学者及其他人士；管理并协助筹办涉及台港澳地区的学术会议、学术演讲及座谈会；归口管理全院涉及台港澳地区的宣传介绍、出版发行、资料交换等；协助研究所、研究中心开展涉及台港澳的学术研究，开展与台港澳地区学术机构合作与交流。台港澳办是联系台港澳地区的窗口，通过与台港澳地区学术机构及各界人士广泛联系，为全院对台港澳交流创造条件，开通渠道，编织纽带。